Misión
Ser una universidad de vanguardia en la formación de las nuevas generaciones indígenas, dotándolas con la fortaleza y capacidades necesarias para mantener y potenciar los conocimientos indígenas, que promuevan la forma de vida comunitaria caracterizada por los valores de su particular cosmovisión.
Visión
La UNEIT se visualiza en el futuro, como un proyecto auténticamente educativo y cultural para los pueblos y comunidades indígenas, viable por la contribución que realiza a la recuperación de lo que se ha perdido de las culturas ancestrales, práctico e innovador en las propuestas de formación, investigación y de implementación de relaciones interculturales. Su proyección favorece la responsabilidad social otorgada por las comunidades indígenas, en momentos especialmente complejos, en que la dinámica de los cambios, afectan tanto a la educación en general, como a las mismas universidades.